Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms