Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms