Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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