Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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