Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CIITA-212ENST00000618207 2844 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CTBP1-AS2-202ENST00000505364 2423 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC093915.1-201ENST00000605740 1543 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ZC3HC1-202ENST00000358303 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 C1orf127-201ENST00000377004 2761 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TTLL13P-206ENST00000641754 2256 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP36-206ENST00000639280 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC079465.1-201ENST00000416046 3361 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms