Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms