Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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