Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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