Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SGCBQ16585 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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