Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms