Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SIX1Q15475 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SIX1Q15475 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SIX1Q15475 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SIX1Q15475 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SIX1Q15475 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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