Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB35Q15286 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB35Q15286 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RAB35Q15286 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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