Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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