Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms