Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms