Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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LAPTM4AQ15012 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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LAPTM4AQ15012 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LAPTM4AQ15012 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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