Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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