Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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DDX39BQ13838 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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DDX39BQ13838 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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DDX39BQ13838 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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DDX39BQ13838 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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DDX39BQ13838 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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DDX39BQ13838 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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DDX39BQ13838 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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