Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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