Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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