Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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