Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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