Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SLC13A2Q13183 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms