Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms