Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms