Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPN11Q06124 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms