Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EMC4-202ENST00000267750 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TPRKB-201ENST00000272424 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ING3-202ENST00000339121 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC01377-201ENST00000505396 649 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms