Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms