Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CACNA1BQ00975 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms