Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms