Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms