Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms