Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms