Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms