Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms