Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCC3P46736 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRCC3P46736 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRCC3P46736 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRCC3P46736 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRCC3P46736 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRCC3P46736 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRCC3P46736 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRCC3P46736 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRCC3P46736 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRCC3P46736 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BRCC3P46736 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms