Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms