Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RECQLP46063 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RECQLP46063 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms