Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms