Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP8P40818 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP8P40818 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP8P40818 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms