Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK1P39086 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms