Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms