Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms