Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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HOXD3P31249 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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HOXD3P31249 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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HOXD3P31249 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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HOXD3P31249 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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HOXD3P31249 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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HOXD3P31249 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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HOXD3P31249 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXD3P31249 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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