Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms