Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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