Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KB1P23443 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms