Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms