Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms