Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms